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MARTIN Pierre authored
json file listing; tests on all 7 steps of pipeline; added testing methods; refactoring main.nf from beggining to process kaiju_index; eggnog fix; diamond fix
2295377c
Suite à des problèmes rencontrés dans les jobs mobilisant une image Docker in Docker (dind), des solutions de contournement ont été proposées.
Voir #148 pour les problèmes de « timeout » sur les runners « test » et #149 pour les problèmes d’accès au démon docker sur les runners « stables ». N’hésitez pas à demander/proposer des compléments aux informations fournies.
json file listing; tests on all 7 steps of pipeline; added testing methods; refactoring main.nf from beggining to process kaiju_index; eggnog fix; diamond fix