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metagWGS is a workflow dedicated to the analysis of metagenomic data. It allows assembly, taxonomic annotation, and functional annotation of predicted genes. It has been developed in collaboration with several CATI BIOS4biol agents. Funded by Antiselfish Project (Labex Ecofect), ExpoMicoPig project (France Futur elevage) and SeqOccIn project (CPER - Occitanie Toulouse / FEDER).
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Projet de la version V2 de l'application des ORE.
Le projet est constitué de 2 sous projet :
La partie serveur qui fournit les web services de l'application
La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service
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An R package for distance between multivariate generalised Gaussian distributions (MGGD), manipulation of MGGD.
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Java library for metabolic networks
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Docker image with Intel Fortran Compiler (and some other dev tools).
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Le projet IlluminaMetabarcodingPipeline a pour but de traiter des séquences issues de séquençage à très haut débit Illumina MySeq et d'en découvrir des modèles
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EJP Soil
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Interekt (INTERactive Exploration of Kinematics and Tropisms) is a user-friendly software for tracking and modeling plant motions.
python image analysis plant+ 2 more -
Nextflow GenomOrder pipeline
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Premier atelier régional du projet PRAPS II
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A presentation and day book area.
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Exploitation et maintenance du thésaurus INRAE, thésaurus ouvert et partagé couvrant les domaines de recherche d’INRAE. Il sert de référentiel au sein de l’institut pour indexer et annoter des documents, pages web, descriptions d’activités, jeux de d
sémantique skos thésaurus+ 1 more -
About Weighted Constraint Satisfaction Problem (WCSP). Réseaux de contraintes pondérées, Réseaux de fonctions de coût. toulbar2 : solver for cost function networks.
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ShinyIDEA permet d'insérer un fichier de données issues de la méthode IDEA4 et de visualiser des premiers résultats synthétiques avant d'exporter des rapports complets sous différents formats. https://shinyidea.sk8.inrae.fr
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Construction and Analysis of Protein-Protein Interactions (PPI) NETWORKS for complexes and biological processes