Explore projects

Annotation pipeline (transform SGBDR/CSV data to rdf)

MassChroQ (Mass Chromatogram Quantification) is a powerful and versatile software that performs retention time alignment, XIC extraction, peak detection and quantification on data obtained from liquid chromatography-mass spectrometry techniques.

Site web du projet SONAR (Synthèse des dOnnées bioéconomiques et iNdicateurs trAnsitions des territoires uRbains) du métaprogramme BETTER https://better.hub.inrae.fr/

Caulifinder : a pipeline for automatic detection and annotation of caulimovirid endogenous viral elements in plant genomes

In frame of EVENT project, all code to build a docker image for the Caulifinder tool. It allows discovering Caulimoviridae sequences in plant genomes.

Projet de la version V2 de l'application des ORE.

Le projet est constitué de 2 sous projet :

La partie serveur qui fournit les web services de l'application

La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service

GWT experiments: minimum and basic dependencies to run on Tomcat along with code quality checkers.

Galaxy wrappers for met4j apps

Java library for metabolic networks

mechanistic-statistical environement

https://olivier.bonnefon.pages.mia.inra.fr/mse/