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Projet de la version V2 de l'application des ORE.
Le projet est constitué de 2 sous projet :
La partie serveur qui fournit les web services de l'application
La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service
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the ontology to describe the interaction between organisms and cultivated plants
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Multivariate generalized Gaussian distribution, Multivariate Cauchy distribution, Multivariate t distribution. Distance between two distributions. Manipulation of these multivariate probability distributions.
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Cette application permet d'estimer un réseau de corrélations entre des variables mixtes (continues et discrètes) en grande dimension. Elle se base sur l'hypothèse d'une structure latente Gaussienne et estime la matrice de corrélation de la copule Gaussienne associée.
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Interekt (INTERactive Exploration of Kinematics and Tropisms) is a user-friendly software for tracking and modeling plant motions.
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Site web de MIAT, avec wowchemy (hugo).
Pour voir vos modifications après un commit, la preview du site web est là : https://miat-com.pages.mia.inra.fr/miat_website
Assignez vos merges requests pour qu'elles soient passés sur le "vrai" site web, à votre correspondant d'équipe : @benjamin.linard, @gauthier.quesnel, @philippe.bordron ou @rtrepos
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Cours accessible à https://genotoul-bioinfo.pages.mia.inra.fr/use-nextflow-nfcore-course/
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Pipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.
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metagWGS is a workflow dedicated to the analysis of metagenomic data. It allows assembly, taxonomic annotation, and functional annotation of predicted genes. Since release 2.3, binning step with the possibility of cross-alignment is included. It has been developed in collaboration with several CATI BIOS4biol agents. Funded by Antiselfish Project (Labex Ecofect), ExpoMicoPig project (France Futur elevage) and SeqOccIn project (CPER - Occitanie Toulouse / FEDER), ATB_Biofilm funded by PNREST Anses, France genomique (ANR-10-INBS-09-08) and Resalab Ouest.
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