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Rnem permet de simuler les dynamiques des interactions entre nématodes phytoparasites (nématodes à galles) et système racinaire des plantes. L'évolution de la virulence des nématodes face à des rotations de cultivars résistants et sensibles est une des applications principales.
Lien vers l'application : https://rnem.sk8.inrae.fr
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PatHways lOngitudianal and diffErential aNanlysis in metabolomICS (PHOENICS). Perform differential analysis of metabolic pathways based on longitudinal metabolomics data.
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Ce projet est une implémentation Rshiny du modèle de culture BilHN. BilHN est un outil d’aide à la décision ayant été développé sur l’Unité Expérimentale d’Auzeville par Jean Marie NOLOT (UMR Agir, Toulouse). C’est un modèle de culture à pas de temps journalier qui permet, pour les principales espèces de grandes cultures et à l’échelle de la parcelle cultivée, d’établir un diagnostic des ressources en eau et en azote disponibles pour les plantes en fonction des conditions pédologique, climatiques et des interventions techniques. Intégrant les données climatiques et géographiques de la parcelle, les caractéristiques agronomiques et texturales du sol, ainsi que celles de la culture en place, il simule et fournit sous forme graphique l’évolution de l’indice d’interception lumineuse du couvert, son état hydrique et azoté, ainsi que le remplissage de la réserve utile et la quantité d’azote disponible dans le sol. Des paramètres permettent l’ajustement du modèle selon l’expertise des agents, sur la base d’observations et/ou de mesures réalisées au champ (qualité du semis, structuration du sol, teneur en eau dans le sol, reliquats azotés, etc.).
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MCQR is a comprehensive set of objects and function for R to handle MassChroQ results.
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Translate specially formatted xlsx (cf. 'fpath') to DMP in .md format.
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ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
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