GitLab

MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.

https://makaho.sk8.inrae.fr

pathway variability analysis using the miom library

L'application a pour objectif de mettre à disposition de mes collègues les fonctionnalités du package {IDEATools} que j'ai développé via une interface presse-bouton. L'application permet d'insérer un fichier de données issues d'une méthode que l'on développe dans l'UR (méthode IDEA), de visualiser des premiers résultats synthétiques puis d'exporter des rapports complets sous différents formats (PDF, DOCX, PPTX, XLSX...)

Benchmark second and third generation sequencing technologies on 3 synthetic microbial communities

R scripts for the calibration of complex ecological model using the method called ABC-RF-SA, based on Approximate Bayesian Computation with Random Forest and Sensitivity Analysis.

DeepGNN: Semi-supervised deep learning with graph neural network for cross-species regulatory sequence prediction

Library to manage in Fortran machine-independent data formats that support the creation, access, and sharing of array-oriented scientific data.

Galaxy wrappers for met4j apps

L'application template de base.

simple : https://sk8-demo.sk8.inrae.fr

catalogue : https://shiny.sk8.inrae.fr/app/sk8-demo

Container avec yade pour Francois Rioual

R scripts for Geonetwork metadata feeding. The scripts are based on the geometa ISOMetadata and geonapi examples given by Emmanuel Blondel (Emmanuel Blondel. (2018, August 22), Blondel, Emmanuel. (2018, April 27)).

Dataset Federator

RTT Dummy Project

Premier atelier régional du projet PRAPS II

i2MassChroQ (identification & inference -- mass chromatogram quantification) is the successor of X!TandemPipeline-Java. Following a full rewrite in C++17 and integration of the MassChroQ module, i2MassChroQ features a quantitative proteomics solution

Le camp de base du Café Forge

SIC² model simulations for flow propagation tests (Enola Henrotin internship March-August 2022)

A set of population genomic scripts and utilities.