Explore projects
-
Updated
-
Updated
-
IN-WOP / IRMaRA
GNU Affero General Public License v3.0Interactive Reservoir MAnagement Risk Assessment (IRMaRA) is a R Shiny interface providing probability of failure of flood and drought objective at key locations downstream of the 4 lakes regulating the Seine River.
Updated -
ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
Updated -
VANRENTERGHEM Théodore / ShinySbm
MIT LicenseshinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.
Updated -
Skander Hatira / BiSePS
MIT LicenseBisulfite Sequencing Processing Software : Snakemake Pipeline
Updated -
Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr
MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr
Updated -
GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
Updated -
Une CLI pour le contrôle d'un cluster kubernetes en python.
Permet de démarrer des "VM" et des grilles condor avec un accès SSH.
Updated -
SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
Updated -
SK8 / sk8-apps / ARA / RIVERLY / MAKAHO
GNU Affero General Public License v3.0MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.
Updated -
SK8 / sk8-apps / ETTIS / ShinyIDEA
GNU General Public License v3.0 onlyShinyIDEA permet d'insérer un fichier de données issues de la méthode IDEA4 et de visualiser des premiers résultats synthétiques avant d'exporter des rapports complets sous différents formats. https://shinyidea.sk8.inrae.fr
Updated -
-
Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.
https://mf-12-1-ha.sk8.inrae.fr/ | https://shiny.sk8.inrae.fr/app/atcha-mf-12-1-ha | https://shiny.sk8.inrae.fr/app_direct/atcha-mf-12-1-ha
Updated -
-
select or stitch the best image for each uplot and save it in "selected_images" directory
Updated -
Cedric Midoux / boardgametools
MIT LicenseUpdated