Explore projects
-
Updated
-
Updated
-
MIAT-Com / Site web MIAT
MIT LicenseSite web de MIAT, avec wowchemy (hugo). Pour voir la version de dev: https://miat-com.pages.mia.inra.fr/miat_website
UpdatedUpdated -
Updated
-
Updated
-
IN-WOP / IRMaRA
GNU Affero General Public License v3.0Interactive Reservoir MAnagement Risk Assessment (IRMaRA) is a R Shiny interface providing probability of failure of flood and drought objective at key locations downstream of the 4 lakes regulating the Seine River.
Updated -
ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
Updated -
VANRENTERGHEM Théodore / ShinySbm
MIT LicenseshinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.
Updated -
Skander Hatira / BiSePS
MIT LicenseBisulfite Sequencing Processing Software : Snakemake Pipeline
Updated -
Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr
MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr
Updated -
GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
Updated -
Une CLI pour le contrôle d'un cluster kubernetes en python.
Permet de démarrer des "VM" et des grilles condor avec un accès SSH.
Updated