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Repository code for the article: Neuvial Pierre, Randriamihamison Nathanaël, Chavent Marie, Foissac Sylvain, and Vialaneix Nathalie (2023) A two-sample tree-based test for hierarchically organized genomic signals. Preprint.

L'application rflomics est un package R couplé à une interface shiny permettant la gestion, l'analyse et l'intégration statistique de plusieurs jeux et types de données -omics: RNAseq, proteomics et metabolomics (pour le moment).

Lien vers l'application : https://rflomics.sk8.inrae.fr

nG6

Site web du projet SONAR (Synthèse des dOnnées bioéconomiques et iNdicateurs trAnsitions des territoires uRbains) du métaprogramme BETTER https://better.hub.inrae.fr/

Site web du projet SONAR (Synthèse des dOnnées bioéconomiques et iNdicateurs trAnsitions des territoires uRbains) du métaprogramme BETTER https://better.hub.inrae.fr/

Rnem permet de simuler les dynamiques des interactions entre nématodes phytoparasites (nématodes à galles) et système racinaire des plantes. L'évolution de la virulence des nématodes face à des rotations de cultivars résistants et sensibles est une des applications principales.

Lien vers l'application : https://rnem.sk8.inrae.fr

https://sequences-rpg.sk8.inrae.fr

ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.

https://explore-metabar.sk8.inrae.fr

Some terminal utilities for Yoctopuce modules

Supports pour la formation shiny - Plateforme de Biostatistique – Génopole Toulouse Midi-Pyrénées

Implementation of the bounded confidence model (opinion dynamics) available on http://jasss.soc.surrey.ac.uk/19/1/6.html