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Semi-supervised learning with pseudo-labeling for regulatory sequence prediction

Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.

https://smgbl-pcdep.sk8.inrae.fr

A set of population genomic scripts and utilities.

R-package to investigate the effects of drying event on metacommunity dynamics in dendritic river networks.

Repository code for the article: Neuvial Pierre, Randriamihamison Nathanaël, Chavent Marie, Foissac Sylvain, and Vialaneix Nathalie (2023) A two-sample tree-based test for hierarchically organized genomic signals. Preprint.

https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/sit-methods/

Datapaper describing dataverse collection on RMQS1 microbiological dataset (The French Soil Quality Monitoring Network). https://entrepot.recherche.data.gouv.fr/dataverse/rmqs_microbio

L'application rflomics est un package R couplé à une interface shiny permettant la gestion, l'analyse et l'intégration statistique de plusieurs jeux et types de données -omics: RNAseq, proteomics et metabolomics (pour le moment).

Lien vers l'application : https://rflomics.sk8.inrae.fr

ViSEAGO: Easier data mining of biological functions organized into clusters using Gene Ontology and semantic similarity. Visualization, Semantic similarity and Enrichment Analysis of Gene Ontology.

The aim of this project is to provide an R package for big integer (and big rational) computations. This is achieved via an C++ interface to the GNU MP ("GMP") library, and S3 classes "bigz", "bigq", etc.