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L'application permet de simuler la dynamique spatio-temporelle de populations de moustiques Aedes (albopictus et aegypti) dans divers environnements et la dynamique de transmission de trois arboviroses : dengue, zika, chikungunya.

Lien vers l'application : https://arbocarto-r-app.sk8.inrae.fr

R package for regression and discrimination, with special focus on chemometrics and high-dimensional data

Online version of the shiny application of the R package SOMbrero to performs Self Organizing Maps (https://sombrero.sk8.inrae.fr)

Pipeline Nextflow

The SeSAM R package allows fully automatic construction of two successive genetic maps: a first one including an optimized subset of markers ensuring the robustness of orders to a given statistical threshold, and a second one including almost all polymorphic markers. It can handle all common types of biparental mapping populations, including progenies obtained from crossing heterozygous parents. In addition to the automatic procedure, SeSAM includes many functions for interactive mapping, file formats conversions, and generates many graphs useful to assess the quality of data and maps.

Doc : https://ecoelec.pages.mia.inra.fr/ecoelecAnalysis/index.html

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr

Fish migration monitoring, database connection and treatment

Statistical analysis using INLA SPDE of the spatio temporal trends in soil P in Britany

PASTE (Platform for Automated Simulation and Tools in Epidemiology) is a software pipeline that produces a web architecture for a decision-support tool based on mechanistic epidemiological models (written with EMULSION)