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Cytometry Analysis of Yeast Spores Segregation Package for automatic analysis of flow cytometry data to measure meiotic recombination rate and crossover interference in regions delimited by fluorescent markers.

Valeurs de shapley pour cartographie freacs

L'application permet, à partir de données de mortalité en élevage de volailles rentrées par l'utilisateur, de calculer les dates les plus probables de la première infection par un virus influenza aviaire hautement pathogène. L'application est basée sur un modèle épidémiologique classique de type SEIR, et l'estimation de la date de la première infection utilise un algorithme d'Approximate Bayesian Computation.

Lien d'accès à l'application https://first-inf.sk8.inrae.fr

code R pour le calcul des valeurs de shapley d'un modèle d'apprentissage dans le cadre de la cartographie

Cette application permet l'exploration, l'interrogation, la visualisation et l’interprétation fonctionnelle d'un ensemble pre-processé de données épigénétiques (ATAC-seq) correspondant à la régulation temporelle des réseaux de transcription pendant la régénération des axones du système nerveux central chez le poisson zèbre.

https://rosetta.sk8.inrae.fr

The SeSAM R package allows fully automatic construction of two successive genetic maps: a first one including an optimized subset of markers ensuring the robustness of orders to a given statistical threshold, and a second one including almost all polymorphic markers. It can handle all common types of biparental mapping populations, including progenies obtained from crossing heterozygous parents. In addition to the automatic procedure, SeSAM includes many functions for interactive mapping, file formats conversions, and generates many graphs useful to assess the quality of data and maps.

This package is a Rshiny implementation of the BilHN crop model designed at INRAE, a decision-support tool developed at the Auzeville Experimental Unit. It is a crop model with daily time steps which allows to establish a diagnosis of water and nitrogen resources available to plants as a function of soil and climatic conditions and technical interventions.

https://bilhn-app.sk8.inrae.fr

An R package for distance between multivariate generalised Gaussian distributions (MGGD), manipulation of MGGD.

Site web de MIAT, avec wowchemy (hugo).

Pour voir vos modifications après un commit, la preview du site web est là : https://miat-com.pages.mia.inra.fr/miat_website

Assignez vos merges requests pour qu'elles soient passés sur le "vrai" site web, à votre correspondant d'équipe : @benjamin.linard, @gauthier.quesnel, @philippe.bordron ou @rtrepos

Hosts the different implementation of EDA model