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Construction and Analysis of Protein-Protein Interactions (PPI) NETWORKS for complexes and biological processes

Source code for the modelling and inference approach implemented by the INRAE team

A standalone version of the function performing dynamic programming in a band

"beads" (billes en Français) est un logiciel de détection et de quantification de spots sur des images de gels d'électrophorèse bidimensionnelle.

BONnes Pratiques sur LA gestioN des Données : https://urep.pages.mia.inra.fr/docs/bonpland

App Nextcloud permettant de publier des fichiers du Nextcloud INRAE vers DataINRAE

Cirad institutional LaTeX package

A shiny application that make time series events selection and modification simpler.

Lien vers l'application : https://crues-r.sk8.inrae.fr

Documentation pour le SI SOERE Prairies Permanentes : https://urep.pages.mia.inra.fr/soere-pp/doc_soere-pp

A gene finding software for eukaryotic and prokaryotic organisms.

Support de présentation pour les sessions de formation bases de Linux et bonnes pratiques de développement informatique

Scripts used in: "Integration of genomic selection into winter-type bread wheat breeding schemes: a simulation pipeline including economic constraints" S. Ben-Sadoun, A. Fugeray-Scarbel, J. Auzanneau, G. Charmet, S. Lemarié, S. Bouchet

select or stitch the best image for each uplot and save it in "selected_images" directory

libmass is a C++ static library that is referenced from other projects.

The libmass static library is designed to enshrine the non-gui functionalities needed by the following two projects:

msXpertSuite/massXpert; msXpertSuite/mineXpert2.

libmass has a companion GUI library, libmassgui , that is designed to enshrine the GUI functionalities needed by the same two projects above.

libmassgui is a C++ static library that is referenced from other projects. The libmassgui static library is designed to enshrine the gui functionalities needed by the following two projects:

msXpertSuite/massXpert; msXpertSuite/mineXpert2.

libmassgui has a companion GUI library, libmass , that is designed to enshrine the non-GUI functionalities needed by the same two projects above.

MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.

https://makaho.sk8.inrae.fr

Produce an epidemiological risk map by weighting multiple risk factors. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/mapMCDA/