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Projet de la version V2 de l'application des ORE.

Le projet est constitué de 2 sous projet :

La partie serveur qui fournit les web services de l'application

La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service

Server : https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S | Doc : https://easy16s.migale.inrae.fr/

Java library for metabolic networks

Pipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.

planemo 4 SIWAA

Base docker image for Rare project

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020

Scripts related with database development in stacomi.

Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.

https://smgbl-pcdep.sk8.inrae.fr

GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr

SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.

https://samba.sk8.inrae.fr/

Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.

https://mf-12-1-ha.sk8.inrae.fr/ | https://shiny.sk8.inrae.fr/app/atcha-mf-12-1-ha | https://shiny.sk8.inrae.fr/app_direct/atcha-mf-12-1-ha

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