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Projet de la version V2 de l'application des ORE.
Le projet est constitué de 2 sous projet :
La partie serveur qui fournit les web services de l'application
La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service
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GeT-nextflow-NGL-Bi / template-nf
CeCILL Free Software License Agreement v2.1Updated -
BIOGER / ingenannot
OtherUpdated -
migale / Easy16S
GNU Affero General Public License v3.0Updated -
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UMR GDEC / magatt
GNU General Public License v3.0 or laterPipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.
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IRHS-Bioinfo / BiSePS
MIT LicenseBisulfite Sequencing Processing Software : Snakemake Pipeline
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DipSO / eosc-pillar / dataverse-jupyterhub-connector
Apache License 2.0Connecteur entre dataverse et jupyterhub
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inter_CATI_omics / hackathon_shiny_2020
GNU General Public License v3.0 onlyAtelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020
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Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.
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GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
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