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PAPPSO / xtpcpp
GNU General Public License v3.0 onlyX!TandemPipeline is a free software (GPL v3) that helps you to filter and group your peptide/protein identifications from MS/MS mass spectra.
Publication: J. Proteome Res. 2017, 16, 2, 494–503 -- https://doi.org/10.102
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Mouhamadou Ba / pesv-tm
Apache License 2.0Archived 1Updated -
Sirius Quality BioMa Wheat LAI module
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umrf / dairydb
GNU General Public License v3.0 onlyUpdated -
DipSO / eosc-pillar / dataverse-jupyterhub-connector
Apache License 2.0Connecteur entre dataverse et jupyterhub
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A small project to set up a filtered search bar like in Gitlab (pipelines page)
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Interface en vue.js pour l'atelier Django-vue 2021.
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Contains code to create and manage the SUDOANG rivers database
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Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr
MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr
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SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
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Cedric Midoux / slides
Creative Commons Attribution Share Alike 4.0 InternationalUpdated -
Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.
https://mf-12-1-ha.sk8.inrae.fr/ | https://shiny.sk8.inrae.fr/app/atcha-mf-12-1-ha | https://shiny.sk8.inrae.fr/app_direct/atcha-mf-12-1-ha
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Dépôt du site internet de la plateforme Genotoul-biostat
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GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
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