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Java library for metabolic networks

Projet de la version V2 de l'application des ORE.

Le projet est constitué de 2 sous projet :

La partie serveur qui fournit les web services de l'application

La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service

This project is the entrypoint for an Information System dedicated to manage a forest experimentation metadata catalog. It relies on a metadata standard available at URL https://data.inrae.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.15454/ELXRGY.

Projet regroupant les codes de l'outil opensilex, systèmes d'Information ouverts pilotés par des ontologies

Partie applicative d'AgroMetInfo.

FAIDARE: FAIR Data-finder for Agronomic Research

It provides web services (based on the BrAPI standard) and a web interface with easy to use filters to facilitates the access to plant datasets from a federation of sources.

Utilisation de SEASON pour le calcul des indicateurs d'AgroMetInfo.

GWT experiments: minimum and basic dependencies to run on Tomcat along with code quality checkers.

FAIR-DATA management application stack for laboratory experiment

Bibliothèque Java pour calculer des indicateurs agro- et éco-climatiques à partir de données climatiques journalières ou horaires et des donnés phénologiques. Un des modèles phénologiques peut être utilisé à la place des données phénologiques. (Documentation en ligne)

GWT experiments: minimum and basic dependencies to run on Tomcat along with code quality checkers.

NGSPipelines integrates pipelines and user interfaces to help biologists to analyse data outputed from biological applications such as RNA-seq, sRNA-seq, Chip-Seq, BS-seq, and so on.

Suivi des Applications jaVa d'Agroclim (Documentation en ligne).

DataDiscovery aims at providing researchers a simple and fast access to relevant biological data using specific keywords and easy to use filters.

This tool is expected to be easily customizable for specific filters, environments, or data schemas.

Annotation pipeline (transform SGBDR/CSV data to rdf)

Project related to the development of a basket for RARe portal (https://urgi.versailles.inrae.fr/rare).