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Server : https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S | Doc : https://easy16s.migale.inrae.fr/

sweep - Spatial Weather and Environmental datas Extraction Package

The sweep package aims to facilitate the extraction of environmental data from various cartographic or spatial sources or APIs. It allows for the retrieval of this information using specific coordinates or spatial grids. This package also formats the extracted data in a way that makes it easily exploitable for further analysis.

Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.

https://smgbl-pcdep.sk8.inrae.fr

Ce projet est une implémentation Rshiny du modèle de culture BilHN. BilHN est un outil d’aide à la décision ayant été développé sur l’Unité Expérimentale d’Auzeville par Jean Marie NOLOT (UMR Agir, Toulouse). C’est un modèle de culture à pas de temps journalier qui permet, pour les principales espèces de grandes cultures et à l’échelle de la parcelle cultivée, d’établir un diagnostic des ressources en eau et en azote disponibles pour les plantes en fonction des conditions pédologique, climatiques et des interventions techniques. Intégrant les données climatiques et géographiques de la parcelle, les caractéristiques agronomiques et texturales du sol, ainsi que celles de la culture en place, il simule et fournit sous forme graphique l’évolution de l’indice d’interception lumineuse du couvert, son état hydrique et azoté, ainsi que le remplissage de la réserve utile et la quantité d’azote disponible dans le sol. Des paramètres permettent l’ajustement du modèle selon l’expertise des agents, sur la base d’observations et/ou de mesures réalisées au champ (qualité du semis, structuration du sol, teneur en eau dans le sol, reliquats azotés, etc.).

https://bilhn-app.sk8.inrae.fr

The Orfeo ToolBox (OTB) extension for Deep Learning. Enable the use of TensorFlow models on Remote Sensing images. Provides OTB applications for patches sampling, model training, model inference, hybrid models, and so on.

Computes soil moisture over agricultural areas

L'application rflomics est un package R couplé à une interface shiny permettant la gestion, l'analyse et l'intégration statistique de plusieurs jeux et types de données -omics: RNAseq, proteomics et metabolomics (pour le moment).

Lien vers l'application : https://rflomics.sk8.inrae.fr

Online version of the shiny application of the R package SOMbrero to performs Self Organizing Maps (https://sombrero.sk8.inrae.fr)