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SK8 / sk8-apps / PHACC / bilhn-app
GNU General Public License v2.0 or laterCe projet est une implémentation Rshiny du modèle de culture BilHN. BilHN est un outil d’aide à la décision ayant été développé sur l’Unité Expérimentale d’Auzeville par Jean Marie NOLOT (UMR Agir, Toulouse). C’est un modèle de culture à pas de temps journalier qui permet, pour les principales espèces de grandes cultures et à l’échelle de la parcelle cultivée, d’établir un diagnostic des ressources en eau et en azote disponibles pour les plantes en fonction des conditions pédologique, climatiques et des interventions techniques. Intégrant les données climatiques et géographiques de la parcelle, les caractéristiques agronomiques et texturales du sol, ainsi que celles de la culture en place, il simule et fournit sous forme graphique l’évolution de l’indice d’interception lumineuse du couvert, son état hydrique et azoté, ainsi que le remplissage de la réserve utile et la quantité d’azote disponible dans le sol. Des paramètres permettent l’ajustement du modèle selon l’expertise des agents, sur la base d’observations et/ou de mesures réalisées au champ (qualité du semis, structuration du sol, teneur en eau dans le sol, reliquats azotés, etc.).
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PAPPSO / MCQR
GNU General Public License v3.0 onlyMCQR is a comprehensive set of objects and function for R to handle MassChroQ results.
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ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
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Cedric Midoux / forkeasy16s
GNU Affero General Public License v3.0Updated -
migale / Easy16S
GNU Affero General Public License v3.0Updated -
MIAT-Com / Site web MIAT
MIT LicenseSite web de MIAT, avec wowchemy (hugo). Pour voir la version de dev: https://miat-com.pages.mia.inra.fr/miat_website
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Package R with a shiny interface to run an interactive differential gene/region expression analysis.
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SK8 / sk8-apps / SA / ASTRE / arbocartoR app
CeCILL-C Free Software License AgreementL'application permet de simuler la dynamique spatio-temporelle de populations de moustiques Aedes (albopictus et aegypti) dans divers environnements et la dynamique de transmission de trois arboviroses : dengue, zika, chikungunya.
Lien vers l'application : https://arbocarto-r-app.sk8.inrae.fr
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GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
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CHIP-GT / AntiPoachingGame
MIT LicenseImplementation of the Anti-Poaching game, a grid-world game between cooperative rangers and independent poachers.
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