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Package R with a shiny interface to run an interactive differential gene/region expression analysis.
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MIAT-Com / Site web MIAT
MIT LicenseSite web de MIAT, avec wowchemy (hugo). Pour voir la version de dev: https://miat-com.pages.mia.inra.fr/miat_website
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CHIP-GT / AntiPoachingGame
MIT LicenseImplementation of the Anti-Poaching game, a grid-world game between cooperative rangers and independent poachers.
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SK8 / sk8-apps / SA / ASTRE / arbocartoR app
CeCILL-C Free Software License AgreementL'application permet de simuler la dynamique spatio-temporelle de populations de moustiques Aedes (albopictus et aegypti) dans divers environnements et la dynamique de transmission de trois arboviroses : dengue, zika, chikungunya.
Lien vers l'application : https://arbocarto-r-app.sk8.inrae.fr
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PAPPSO / MCQR
GNU General Public License v3.0 onlyMCQR is a comprehensive set of objects and function for R to handle MassChroQ results.
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Orfeo ToolBox / otbtf
Apache License 2.0The Orfeo ToolBox (OTB) extension for Deep Learning. Enable the use of TensorFlow models on Remote Sensing images. Provides OTB applications for patches sampling, model training, model inference, hybrid models, and so on.
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SK8 / sk8-apps / ARA / RIVERLY / MAKAHO
GNU Affero General Public License v3.0MAKAHO (pour MAnn-Kendall Analysis of Hydrological Observations) est un système de visualisation cartographique interactif permettant d’examiner les tendances présentes dans les données des stations hydrométriques aux débits peu influencés par les actions humaines. Le test de Mann-Kendall permet d’analyser la significativité des tendances de variables hydrologiques sur les différentes composantes du régime des cours d'eau (étiages, moyennes-eaux, crues), à mettre ensuite en relation avec les impacts du changement climatique sur l’hydrologie de surface.
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in-sylva development / in-sylva.information-system
GNU General Public License v3.0 or laterThis project is the entrypoint for an Information System dedicated to manage a forest experimentation metadata catalog. It relies on a metadata standard available at URL https://data.inrae.fr/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.15454/ELXRGY.
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GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
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ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
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migale / Easy16S
GNU Affero General Public License v3.0Updated -