Explore projects

SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.

https://samba.sk8.inrae.fr/

shinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.

Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.

https://mf-12-1-ha.sk8.inrae.fr/ | https://shiny.sk8.inrae.fr/app/atcha-mf-12-1-ha | https://shiny.sk8.inrae.fr/app_direct/atcha-mf-12-1-ha

planemo 4 SIWAA

Create an AppImage containing GfaViz

Cette application permet l'exploration, l'interrogation, la visualisation et l’interprétation fonctionnelle d'un ensemble pre-processé de données épigénétiques (ATAC-seq) correspondant à la régulation temporelle des réseaux de transcription pendant la régénération des axones du système nerveux central chez le poisson zèbre.

https://rosetta.sk8.inrae.fr

Tropolink backend (API)

Produce an epidemiological risk map by weighting multiple risk factors. https://umr-astre.pages.mia.inra.fr/mapMCDA/

In frame of EVENT project, all code to build a docker image for the Caulifinder tool. It allows discovering Caulimoviridae sequences in plant genomes.

Archiving packages generation and export from Dataverse to Vitam platform.

ShinyIDEA permet d'insérer un fichier de données issues de la méthode IDEA4 et de visualiser des premiers résultats synthétiques avant d'exporter des rapports complets sous différents formats. https://shinyidea.sk8.inrae.fr

Run Ocelet in a docker container.