Explore projects
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Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.
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GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
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Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr
MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr
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SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
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VANRENTERGHEM Théodore / ShinySbm
MIT LicenseshinySbm is a package containing a shiny application. This application is build for network analysis based on the sbm package made by Chiquet J, Donnet S and Barbillon P (2023) CRAN. It allow to apply and explore the outputs of a Stochastic Block Model. It is useful if you want to analyse your data (could be adjacency matrix or edges list) without R language knowledge or to learn the basic lines of the sbm package.
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SK8 / sk8-apps / ARA / RIVERLY / cruesR
GNU General Public License v3.0 or laterA shiny application that make time series events selection and modification simpler.
Lien vers l'application : https://crues-r.sk8.inrae.fr
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record / Tabular File Checker
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ExploreMetabar is a shiny application used to explore metabarcoding data (16S, ITS) with interactive plots, integrated statistical tests, and differential analysis.
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L'application rflomics est un package R couplé à une interface shiny permettant la gestion, l'analyse et l'intégration statistique de plusieurs jeux et types de données -omics: RNAseq, proteomics et metabolomics (pour le moment).
Lien vers l'application : https://rflomics.sk8.inrae.fr
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select or stitch the best image for each uplot and save it in "selected_images" directory
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in-sylva development / MetadataStandardAndTtools / MetadataValidation / in-sylvajsonschemavalidator
OtherApplication python pour controler la conformité d'un fichier json en fournissant un schéma json.
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SK8 / sk8-apps / SA / ASTRE / arbocartoR app
CeCILL-C Free Software License AgreementL'application permet de simuler la dynamique spatio-temporelle de populations de moustiques Aedes (albopictus et aegypti) dans divers environnements et la dynamique de transmission de trois arboviroses : dengue, zika, chikungunya.
Lien vers l'application : https://arbocarto-r-app.sk8.inrae.fr
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Stephane Dervaux / LodView
MIT LicenseUpdated