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GQE-ABISoft / DiverCILand
GNU Affero General Public License v3.0Updated -
PO2-Tools / PO²Manager
MIT LicenseUpdated -
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Contains code to create and manage the SUDOANG rivers database
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Application de reporting / datavisualisation qui a pour objectif de fournir une série d’indicateurs visuels et synthétiques représentatifs des volumes d’interventions sur les postes de secours ayant pris part au projet SWYM pour la collecte numérique de données via ODK.
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GraphstatsR est une application permettant le l'analyses de données de quantification métabolomiques prétraitées (MS, RMN). Elle permet la génération d'analyse descriptive (ACP), de représentations graphiques type boxplot avec tests statistiques associées, cela avec une interactivité permettant à l'utilisateur d'ajuster au mieux les analyses. Cette application peut traiter des données issues d'autres méthodes à condition de fournir des fichiers d'entrée au bon format. https://graphstatsr.sk8.inrae.fr
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SAMBA (R) est une interface pour analyser les résultats de sampling de réseaux métaboliques générés à partir de SAMBApy sous Python. Elle est composée d'une une partie comparaison (calcul de différence) et une partie visualisation graphique des résultats.
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FROGS / FROGS
GNU General Public License v3.0 onlyFROGS is a galaxy/CLI workflow designed to produce an OTUs count matrix from high depth sequencing amplicon data.
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Exploration interactive de scenario de simulation du modèle MF1.2-1ha du projet Atcha.
https://mf-12-1-ha.sk8.inrae.fr/ | https://shiny.sk8.inrae.fr/app/atcha-mf-12-1-ha | https://shiny.sk8.inrae.fr/app_direct/atcha-mf-12-1-ha
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SK8 / sk8-apps / ISPA / justep
CeCILL Free Software License Agreement v1.0Ajustement de différents modèles statistiques de courbes de réponse (réponse culture vs indicateur de disponibilité en éléments minéraux du sol).
Lien vers l'application : https://justep.sk8.inrae.fr
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Dépôt du site internet de la plateforme Genotoul-biostat
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Link to running app: https://matrixapp.sk8.inrae.fr
MATRiX is a shiny application dedicated to Mining and Analysis of Transcriptomics data using common biostatistic result files (statistical test result table, normalised data table and samples-groups information). This application helps biologists to perform data exploration with PCA, Venn diagrams, StripCharts, volcanoplots, and Heatmap clustering of genes lists (selecting statistical thresholds) and functional enrichment analyses using a connection to enrichr. https://matrixapp.sk8.inrae.fr
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