Erreur dans hm$x$data[[col]] : un tel index n'existe pas au niveau 2
Bonjour,
petit "bug" que je n'arrive pas à comprendre dans la fonction ViSEAGO::GOterms_heatmap
avec l'ontology 'CC' (fonctionne avec les autres ontologies).
Voici mon code (copier coller du tuto) :
Wang_clusters_wardD2 <- ViSEAGO::GOterms_heatmap(
myGOs,
showIC=TRUE,
showGOlabels=TRUE,
GO.tree=list(
tree=list(
distance="Wang",
aggreg.method="ward.D2"
),
cut=list(
dynamic=list(
pamStage=TRUE,
pamRespectsDendro=TRUE,
deepSplit=2,
minClusterSize =2
)
)
),
samples.tree=NULL
)
Voici mon objet myGOs
.
myGOs.rda
Merci pour ce super package et merci d'avance pour votre aide !
Sébastien