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Created with Raphaël 2.2.01Dec27Nov262524173230Oct29282623222120191615822Sep2110720Aug181126Jun252423222118159543129May28271211765430Apr292827242321201714131032131Mar3027262564230Jan292827242322201716151310820Dec19181716131211106413Nov8518Oct16327Sep261630Aug282712Jul111015Mar24Jan2118171610943217Dec141311107630Nov292827232216151412986531Oct30292423221918171612111098543228Sep272625212019181714137654329Aug2423222117161076331Jul2019181716131211109654328Jun65131May302524171694326Apr2019116adding fraction_order, trck and track_order column to generated metadata correction of a little bug that block the functionmodificaion of graph layoutadding cmcq.protq.by.track to object allowed for percent spectralcount normalisationtest implemntation de method via heritage (en attente)modification NAMESPACE du a changement de mcq.drop.low.proteins de function a methode optimisation de mcq.drop.low.proteins et passage en method de classe ajout onLoad function to set data_table usage on loadingajout fonction pour parametrer le nombre de threzad utiliser par data.table dans mcqr et aide associermodification numero de version vers 0.5.1correction bug sur mcq.compute.pca si des proteines ne varie pasajout sortie text du nombre de pic pour la commande mcq.plot.counts.per.injection supprimer precedementcorrection la fonction mcq.get.metadata genere un tableau sans la colonne msrun pour les objet cmcq.pepq.masschroqajout script pour maj local de mcqrstart implementation of method for cmcq.pepq.by.trackimplementation de mcq.drop.by.class pour cmcq.pepq.masschroq et pour cmcq.pepq.masschroq.labelingstarting refactoring of mcq.drop function stocked in mcq.drop.by.classsupprission de la colonne msrun créer dans metadata@injections lors de la misea jours des metadataajout support de la classe cmcq.protq.by.track dans les source de SCsupprission de la colonne msrun créer dans metadata@injections lors de la sélectionmodification en character des factuer utiliser si ils sont en numeric et correction plot ( scales = free_y)correction liée a la modification fraction_order et track_ordercorrection liée a la modification fraction_order et track_ordermodification pour eviter de perdre les ligne avec NA pour le temps de ms1correction nom fraction_order et modification algorythme deselection pou simplifier le codemodification typomodification adresse de maintainerajout de mcq.plot.alignement dans les fonctions utilisableajout dataset reduit pour streptocorrection test de l'argument by_fraction dans le cadre des analyses de fractionnementcorrection erreur sur la mise a jour des données de metadata@injectionscorrection comportement si les factor sont des numeric (test du facteur utilisé et si numeric transformation en character) => non fonctionnelcorrection comportement si les factor sont des numeric (test du facteur utilisé et si numeric transformation en charactercorrection probleme de comportement les tracks etait mal defini et plusieur échantillons avait le meme nontemplate a priori ok tester avec données jamet "20140307_albenne_103"correction lanceur pour etre en accord avec les nouvelles fonctionscorrection refMsrun vers refSample pour etre en accord avec la methodeajout de test pour ne pas chercher la proba.good.model dans les objet cmcq.anova si elle ne le contient pasajout d'un test de l'objet fournit par l'argument protlist pour s'assurer qu'il s'agit bien d'un objet cmcq.protlistavancée correction lanceur sds