problème dans mcq.get.dataframe ?
petit problème en testant mcq.get.dataframe :
XICRAW <- mcq.read.masschroq(protFile = "/gorgone/pappso/moulon/users/Olivier/20240131_proteobench/masschroq/result_proteobench_2pep_fdr09.d/All_samples_proteins.tsv", pepFile = "/gorgone/pappso/moulon/users/Olivier/20240131_proteobench/masschroq/result_proteobench_2pep_fdr09.d/peptides_q1_All_samples.tsv")
META <- mcq.read.metadata("/gorgone/pappso/moulon/users/Olivier/20240131_proteobench/mcqr/metadata.ods")
XICRAW <- mcq.add.metadata(XICRAW, metadata=META)
df_test <- mcq.get.dataframe(XICRAW)
donne :
Erreur dans rbind.data.frame(tab, object@proteins[!object@proteins$peptide %in% :
les nombres de colonnes des arguments ne correspondent pas
NB : j'ai un commit dans get dataframe pour prendre en compte la colonne ProForma.
Je voudrais obtenir les accessions redondantes jointes avec des ";" et je ne comprends pas le code de la fonction
Merci
A+