change the method of clustering

Visualisation_des_donnes_de_mapping.py

@@ -105,17 +105,60 @@ def visualisation_recouvrement (File, titre_du_graphique="Recouvrement moyen des
     p1.tick_params(axis='x', rotation=90, size=1) #rotation des ticklabels
     plt.show()
 
-visualisation_recouvrement ("C:\\Users\\mumec\\Desktop\\Mini_codes\\fichier_pour_tests_graph.xlsx",titre_du_graphique="Recouvrement moyen des différentes voies métaboliques de la liste constructeurs sur KEGG")
+#visualisation_recouvrement ("C:\\Users\\mumec\\Desktop\\Mini_codes\\fichier_pour_tests_graph.xlsx",titre_du_graphique="Recouvrement moyen des différentes voies métaboliques de la liste constructeurs sur KEGG")
 
 
 
 
+def boite_a_moustache(File_of_data, titre_de_la_boite="boite a moustache des mes données",numero_de_la_colonne_a_grapher=1,numero_de_la_colonne_de_labels=0 ):
+    dataframe= pd.read_excel(File_of_data)
+    colnames = list(dataframe.columns)
+    Data=dataframe[colnames[numero_de_la_colonne_a_grapher]].tolist()
+
+    print(Data)
+    plt.boxplot(Data)
+    plt.ylim(0,max(Data)+2)
+
+#    plt.savefig('SimpleBoxPlot.png')
+    plt.show()
+
+#☻boite_a_moustache("C:\\Users\\mumec\\Desktop\\Mini_codes\\fichier_pour_test_moustache.xlsx", titre_de_la_boite="boite a moustache des mes données")
+
 
 
+def Camenbert(File_of_data, titre_de_la_boite="boite a moustache des mes données",numero_de_la_colonne_a_grapher=1,numero_de_la_colonne_de_labels=0, valeur_filtrage=100, barplot="oui"):
+    dataframe= pd.read_excel(File_of_data)
+    colnames = list(dataframe.columns)
+
+    Data=dataframe[colnames[numero_de_la_colonne_a_grapher]].tolist()
+    labels=dataframe[colnames[numero_de_la_colonne_de_labels]].tolist()
+
+    object_gardes=[]
+    labels_gardes=[]
+    Total=sum(Data)
+    for indice in range (len(Data)) :
+        if Data[indice]>= (Total*valeur_filtrage/100):                   #plus de valeur_filtrage des interactions
+            object_gardes.append(Data[indice])
+            labels_gardes.append(labels[indice])
 
+    if barplot=="oui" :
 
+        fig, ax = plt.subplots()
 
+        ax.bar(labels_gardes, object_gardes)
+        ax.bar_label(ax.containers[0])
+        ax.set_ylabel('fréquence des métabolites')
+        ax.set_title('Les métabolites les plus présents')
+        ax.tick_params(axis='x', rotation=90, size=1)
+        plt.show()
 
+    object_gardes.append(Total-sum(object_gardes))
+    labels_gardes.append("autre")
+
+
+    print(object_gardes)
+    plt.pie(object_gardes,labels=labels_gardes)
+    plt.show()