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......@@ -22,13 +22,13 @@ Un Hackathon pour partager des compétences en terme du développement logiciel
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| Vendredi 20 novembre| 9:00 - 12:00 | Yvan & Patrick | Lancement & Introduction | https://training.galaxyproject.org/training-material/topics/admin/tutorials/interactive-tools/slides.html#1 |
| Mardi 8 décembre| 9:00 - 17:30 | Anthony & Estelle | Admin - Configurer Galaxy | https://galaxyproject.github.io/training-material/topics/admin/tutorials/ansible-galaxy/tutorial.html et https://galaxyproject.github.io/training-material/topics/admin/tutorials/interactive-tools/tutorial.html |
| Jeudi 10 et vendredi 11 décembre| 9:00 - 13:00 | Franck & Yvan & ? | Développement d'IT pour Galaxy | --- |
| Mercredi 9/12 et jeudi 10 décembre| 9:00 - 13:00 et 9:00 - 13:00 | Franck, Yvan , Lain, Romain, Coline, Elly | Développement d'IT pour Galaxy | --- |
## Programme et prérequis
Le nouveau système des interactives tools du framework galaxy permet de d'ajouter dans la tool box des applications web. Les utilisateurs peuvent ainsi bénéficier d'interface graphiques dynamiques comme par exemple (https://shiny.rstudio.com) Rshiny, [RStudio](https://rstudio.com/) ou [jupyter](https://jupyter.org), ce qui constitue un progrès très important en terme d'ergonomie.
Le nouveau système des interactives tools du gestionnaire de workflow galaxy permet de d'ajouter dans sa boite à outils des applications web. Les utilisateurs peuvent ainsi bénéficier d'interface graphiques dynamiques comme par exemple [Rshiny](https://shiny.rstudio.com), [RStudio](https://rstudio.com/) ou [jupyter](https://jupyter.org), ce qui constitue un progrès très important en terme d'ergonomie.
Du point de vue de l'architecture logicielle, les interactives tools reposent sur une pile de technologies informatiques plus complexe que les tools classiques. Et comme il s'agit de développements récents, la documentation sur le sujet est encore lacunaire.
Du point de vue de l'architecture logicielle, les `interactives tools` reposent sur une pile de technologies informatiques plus complexe que les tools classiques. Et comme il s'agit de développements récents, la documentation sur le sujet est encore lacunaire.
Afin de nous approprier ce nouveau système de façon collective, nous proposons un ensemble de 4 séquence de travail permettant de progresser à la fois sur la compréhension globale du système, l'administration système sous-jacente et le dévelopement de cette nouvelle génération d'outils.
......@@ -56,13 +56,38 @@ Nous aurons un retour d'expérience sur le lancement des interactive tools sur u
### Hackathon - dev
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L'objectif de cette double scéance est de comprendre et prendre en main le processus de construction d'un `interactive tool` à partir d'exemples concrets, voire de son propre projet pour les participants les plus avancés. Initialement prévue en présentielle, nous avons souhaité maintenir cette session à distance !
**Cible** :
les développeurs d'outils de visualisation de données (R, Python, ...) souhaitant enrichir des workflows Galaxy existants ou publier leur applications sur des plateformes de traitement publiques comme [usegalaxy.fr](usegalaxy.fr) ou [usegalaxy.eu](usegalaxy.eu).
**Prérequis** :
Avoir assister aux premières sessions (Introduction + Configurer Galaxy I et II) pour avoir une première connaissance des piles logiciels utilisées.
**Contenu** :
*Matinée du mercredi 09 décembre (9:00 - 13:00)*
> + Introduction - Franck & Yvan
> + Reprise en main de la VM du hack - Lain & Anthony
> + **UseCase 01** - Installation de l'`interactive tool` RStudio - All
*Matinée du jeudi 10 décembre (9:00 - 13:00)*
> + **UseCase 02** - Developpement et intégration d'un `interactive tool` à choisir parmi plusieurs exemples issues des communautés Ecologie et Métabolomique - All
> + OU **UseCase 03** - **"Bring your own app"**<span style="color:red">*</span> - All
<span style="color:red"><sup>\*</sup></span> A propos de la session **"Bring your own app"** : Vous êtes développeurs sur des outils R, Rshiny ou Python, en lien avec la visualisation et connaissant Docker? Vous avez un developpement fonctionnel et ce développement a été containarisé (Dockerfile écrit et fonctionnel). Venez donc avec votre propre projet afin de l'intégrer en tant qu'`interactive tool` - Contactez nous !
## Localisation
En visio, lien en préparation.
## Inscriptions
20-25 participants
Remplir le formulaire suivant : https://framaforms.org/hackathon-gxit-2020-inscription-1602514404
## Questions
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