... | @@ -56,7 +56,7 @@ nextflow run -profile test_genotoul_workq <metagwgs-src>/main.nf \ |
... | @@ -56,7 +56,7 @@ nextflow run -profile test_genotoul_workq <metagwgs-src>/main.nf \ |
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**Pour cela allez voir dans le répertoire work et faites affiché les fichiers cachés par la commande ls –la.**
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**Pour cela allez voir dans le répertoire work et faites affiché les fichiers cachés par la commande ls –la.**
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**Investiguez les fichiers** `.command.log`**,**` .command.err `**et** `.command.sh` **pour trouver l’erreur.** La corriger et relancer le workflow avec l’option **–resume** de nextflow (changer le launch.sh). Monitorez les jobs avec un` squeue –u nomdeFleur` et ce qui s’écrit dans le nouveau trace.txt.
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**Investiguez les fichiers** `.command.log`**,**`.command.err`**et** `.command.sh` **pour trouver l’erreur.** La corriger et relancer le workflow avec l’option **–resume** de nextflow (changer le launch.sh). Monitorez les jobs avec un` squeue –u nomdeFleur` et ce qui s’écrit dans le nouveau trace.txt.
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**Questions :**
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**Questions :**
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