... | ... | @@ -68,7 +68,7 @@ nextflow run -profile genotoul <metagwgs-src>/main.nf \ |
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1. Qu'est-ce que des lectures HiFi ? Comment sont-elles générées ? Qu'elles sont les différences entre des lectures Illumina NovaSeq (pairées, 2x150 pb) et des lectures HiFi Pacbio ? Regarder au moins cette page : https://www.pacb.com/technology/hifi-sequencing/
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1. Qu’est-ce que la répétabilité d’une analyse ? La reproductibilité d’une analyse ?
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2. En quoi NextFlow et Singularity peuvent aider à améliorer répétabilité et reproductibilité ?
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2. En quoi NextFlow et Singularity peuvent aider à améliorer répétabilité et reproductibilité dans le cas d'une analyse bioinformatique?
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3. Que signifient les options NextFlow suivantes, à quoi servent-elles ? `-profile, -with-report, -with-timeline, -with-trace, -with-dag, -resume` ?
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4. A quoi sert le fichier de config : hifi_data_workq.config ?
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5. Explicitez en quoi consistent les étapes 1 à 8 du workflow en un résumé d’une page maximum en tout.
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