R

Cette application permet aux utilisateurs de visualiser les caractéristiques physicochimiques de plus de 100 produits, ainsi que de comparer entre eux différents produits avec des boxplots.

https://eom-4-soil-visualisation-tool.sk8.inrae.fr/

R package to run MuSICA

Replication repository for the article "A comprehensive review and benchmark of differential analysis tools for Hi-C data"

Cette application permet l'exploration, l'interrogation, la visualisation et l’interprétation fonctionnelle d'un ensemble pre-processé de données épigénétiques (ATAC-seq) correspondant à la régulation temporelle des réseaux de transcription pendant la régénération des axones du système nerveux central chez le poisson zèbre.

https://rosetta.sk8.inrae.fr

mixKernel is a multiple kernel framework that allows to integrate multiple datasets of various types into a single analysis. The package is published on CRAN: https://cran.r-project.org/package=mixKernel

Développement d’une petite application Shiny et déploiement de celle-ci avec sk8, animé par Amandine Velt (SVQV) et Joseph Tran (EGFV) [AG CATI BARIC La Rochelle, 26-28/03/2024]

slides: https://joseph.tran.pages.mia.inra.fr/quarto-shiny-sk8

tutoriel: https://forgemia.inra.fr/joseph.tran/shiny-tutorial

Learn how to build a shiny application

Développement d’une petite application Shiny et déploiement de celle-ci avec sk8, animé par Amandine Velt (SVQV) et Joseph Tran (EGFV) [AG CATI BARIC La Rochelle, 26-28/03/2024]

slides: https://baric.pages.mia.inra.fr/quarto-shiny-sk8

tutoriel: https://forgemia.inra.fr/baric/shiny-tutorial

Learn how to build a shiny application

R scripts for the calibration of complex ecological model using the method called ABC-RF-SA, based on Approximate Bayesian Computation with Random Forest and Sensitivity Analysis.

Atelier développement d’une application interactive Shiny lors du hackathon inter-CATI omics 2020

Fluidigm QPCR normalisation and statistical analysis.