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# Formation au package airGRiwrm
## Installation des packages pour les apprenants
L'installation a été testée pour les versions de R supérieures ou égales à 3.6.
### Pour les utilisateurs sous Linux ou sous Windows avec Rtools
Vous pouvez alors installer airGR en compilant les sources, il suffit de taper la commande suivante :
```r
install.packages("remotes")
remotes::install_gitlab("in-wop/airGRiwrm", host = "gitlab.irstea.fr", dependencies = TRUE)
```
### Pour les utilisateurs sous Windows sans Rtools
Installer les dépendances nécessaires à airGRiwrm pour la formation :
```r
install.packages(c("dplyr", "DiagrammeR"))
```
Télécharger les fichiers suivants :
- https://stratus.irstea.fr/d/3e3e85e50ff8483d9d79/files/?p=/airGR_1.6.12.9000.zip&dl=1
- https://stratus.irstea.fr/d/3e3e85e50ff8483d9d79/files/?p=/airGRiwrm_0.5.0.9000.zip&dl=1
Installer les deux packages sous R avec les lignes de commande suivantes :
```r
install.packages("[Chemin du fichier téléchargé]/airGR_1.6.12.9000.zip")
install.packages("[Chemin du fichier téléchargé]/airGRiwrm_0.5.0.9000.zip")
```
### Vérification de l'installation
Taper les instructions dans la ligne de commande:
```r
library(airGRiwrm)
example("RunModel.GRiwrmInputsModel")
```
L'exécution doit se dérouler sans erreur avec l'affichage de 3 graphiques. Seuls quelques warnings apparaîtront concernant la période de warm-up indéfinie et éventuellement la version de airGR compilée avec une version différente de votre version de R. Si l'exécution provoque une erreur, contactez-moi sur david.dorchies@inrae.fr.
## Installation des packages pour le formateur
Installer les dépendances de la présentation :
```r
install.packages("xaringan", "pagedown")
remotes::install_github("gadenbuie/xaringanExtra")
```
## Génération de la présentation au formats HTML et PDF
Le knit de la présentation sous Rstudio génère un document HTML et un PDF.
Pour être utilisé à un autre emplacement, le fichier HTML doit être accompagné des dossiers Formation_airGRiwrm_files, img, libs, styles et du fichier macro.js.
### Problèmes connus
Les HTMLwidgets dans le PDF sont aléatoirement présents (ici les schémas de réseau). C'est un problème connus du package **pagedown** (Voir https://github.com/rstudio/pagedown/issues/58).