Spécifications

1. Contexte scientifique

Il existe différents outils permettant de faire de l’assemblage de génomes. Nous voulons ensuite les comparer sous forme de dotplots. Récemment, l’outil minimap permettant le mapping de 2 séquences a sorti une version 2 très rapide. Nous voulons créer une interface graphique permettant de les visualiser de manière graphique et interactive.

2. Description de la demande

Créer une application web avec un formulaire permettant de lancer minimap2 sur les séquences fourniées, puis une interface en javascript permettant de visualiser les maps de manière interactive.

3. Organisation

3.1 Planning

Développement rapide sur 5 mois

3.2 Personnes

Implémentation :

• Floréal Cabanettes

Tests :

• Christophe Klopp

3.3 Ressources matériels

Aucun besoin spécifiques

3.4 Ressources financières

Sur budget propres

4. Échéancier

Fin septembre 2017 : début du projet
Fin février 2018 : tests finaux

5. Critères de validations

Données de test fournies avec l’application