Add missing inputs for reference bundle
Dans Jflow, on avait des inputs supplémentaires :
- reference ploidy map (on met actuellement tout en diploïde)
- reference gendermask
On demandait également les chromosomes sexuels pour le rdmask, ce qu'on ne fait plus.
Ne doit-on pas ajouter ceci à la version snakemake (en paramètres optionnels bien sûr) ?