MetExploreViz issueshttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues2023-03-10T11:54:05+01:00https://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/190[Minor] La suppression définitive d'un mapping n'impacte pas le choix de mapp...2023-03-10T11:54:05+01:00Maxime Chazalviel[Minor] La suppression définitive d'un mapping n'impacte pas le choix de mapping de MetExploreVizLorsqu'on supprime définitivement un (ou plusieurs) mapping, MetExploreViz le propose toujours dans son menu de mapping.Lorsqu'on supprime définitivement un (ou plusieurs) mapping, MetExploreViz le propose toujours dans son menu de mapping.Maxime ChazalvielMaxime Chazalvielhttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/168[viz] import json et mapping2023-03-07T14:12:49+01:00Nathalie Poupinnathalie.poupin@inrae.fr[viz] import json et mappingQuand on importe un json dans la vizu et qu'on choisit d'importer également le mapping, tous les mapping qui avaient été fait lors de la session pendant laquelle le json a été créé sont importés et pas uniquement celui qui était affiché ...Quand on importe un json dans la vizu et qu'on choisit d'importer également le mapping, tous les mapping qui avaient été fait lors de la session pendant laquelle le json a été créé sont importés et pas uniquement celui qui était affiché sur le réseau au moment de la sauvegarde du json : peut être que cela serait mieux de garder uniquement le mapping affiché lors de l'export ?Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardohttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/164[viz] mapping reste sélectionnable dans la vizu même après avoir été supprimé2023-03-07T14:12:45+01:00Nathalie Poupinnathalie.poupin@inrae.fr[viz] mapping reste sélectionnable dans la vizu même après avoir été suppriméLorsqu'on supprime un mapping, celui-ci apparait toujours dans le menu déroulant dans la vizuLorsqu'on supprime un mapping, celui-ci apparait toujours dans le menu déroulant dans la vizuJean-Clement GallardoJean-Clement Gallardohttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/165[viz] mettre une légende pour le mapping ?2023-03-07T14:32:27+01:00Nathalie Poupinnathalie.poupin@inrae.fr[viz] mettre une légende pour le mapping ?Ce serait pratique de pouvoir afficher une légende pour le mapping sur la vizu (ça éviterait de la faire avec ppt ;-) )
Et il faudrait pouvoir la "personnaliser" en modifiant les intitulés, etc ...Ce serait pratique de pouvoir afficher une légende pour le mapping sur la vizu (ça éviterait de la faire avec ppt ;-) )
Et il faudrait pouvoir la "personnaliser" en modifiant les intitulés, etc ...Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardohttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/166[Viz] Pas simple pour déselectionner des noeuds2023-03-07T14:12:47+01:00Ludovic Cottret[Viz] Pas simple pour déselectionner des noeudsIl faut recliquer dessus quand on veut le deselectionner. A moins que je n'ai pas trouvé d'autres moyens. Bref, quand on en a un tas à déselectionner, ce n'est vraiment pas pratique...Il faut recliquer dessus quand on veut le deselectionner. A moins que je n'ai pas trouvé d'autres moyens. Bref, quand on en a un tas à déselectionner, ce n'est vraiment pas pratique...Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardohttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/162[viz] remove node ne fonctionne pas quand les arrètes sont en arcs2023-03-06T17:39:32+01:00Nathalie Poupinnathalie.poupin@inrae.fr[viz] remove node ne fonctionne pas quand les arrètes sont en arcslorsque j'ai mis les arrêtes en "arrodis" la fonction "remove node" (clic droit sur un noeud) ne fonctionnait plus : la première fois le noeud n'était pas supprimé et la 2ème fois ça a complètement planté !lorsque j'ai mis les arrêtes en "arrodis" la fonction "remove node" (clic droit sur un noeud) ne fonctionnait plus : la première fois le noeud n'était pas supprimé et la 2ème fois ça a complètement planté !Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardohttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/84Abstractions de réactions ayant les mêmes sources et les mêmes produits2020-04-07T14:53:29+02:00Maxime ChazalvielAbstractions de réactions ayant les mêmes sources et les mêmes produitsRelease abstractionAmina TaouiAmina Taouihttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/36Abstraire une sélection2019-03-21T16:46:55+01:00Maxime ChazalvielAbstraire une sélectionhttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/178Add information in bug tracker2023-03-07T14:12:56+01:00Maxime ChazalvielAdd information in bug trackerMaxime ChazalvielMaxime Chazalvielhttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/11Affichage de plusieurs mapping sur un noeud2019-03-21T16:46:49+01:00Maxime ChazalvielAffichage de plusieurs mapping sur un noeudA définirhttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/206Afficher genes sur visu2023-03-10T11:55:13+01:00Maxime ChazalvielAfficher genes sur visuun truc que je fais souvent à la main : ajouter les gènes qui codent pour la réaction. Ca serait bien dans le menu contextuel de la réaction, pouvoir ajouter sur la visu, à côté de la réaction les gènes impliquésun truc que je fais souvent à la main : ajouter les gènes qui codent pour la réaction. Ca serait bien dans le menu contextuel de la réaction, pouvoir ajouter sur la visu, à côté de la réaction les gènes impliquésMaxime ChazalvielMaxime Chazalvielhttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/223afficher le sens des réactions en fonction des bornes de flux2023-04-12T21:28:12+02:00Nathalie Poupinnathalie.poupin@inrae.frafficher le sens des réactions en fonction des bornes de fluxpour les réactions dont l'intervalle de flux est complètement négatif (lower bound et upper bound <=0), il faut inverser les sources et targets.
Pour tous les autres cas (si intervalle positif ou négatif/positif), ne rien changer !pour les réactions dont l'intervalle de flux est complètement négatif (lower bound et upper bound <=0), il faut inverser les sources et targets.
Pour tous les autres cas (si intervalle positif ou négatif/positif), ne rien changer !Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardohttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/41Ajouter des images 1er plan ou en font2019-03-21T16:46:56+01:00Maxime ChazalvielAjouter des images 1er plan ou en fontA définirhttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/133ajouter size (height + width)2022-04-04T10:56:35+02:00Ludovic Cottretajouter size (height + width)Comme dans Cytoscape, ca serait bien de pouvoir avoir dans le style, un item size qui fait grandir à la fois le height et le width d'un noeud. C'est souvent lourd de regler les deux séparément. Par contre, il faudrait desactiver height e...Comme dans Cytoscape, ca serait bien de pouvoir avoir dans le style, un item size qui fait grandir à la fois le height et le width d'un noeud. C'est souvent lourd de regler les deux séparément. Par contre, il faudrait desactiver height et width si on change size...Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardo2022-04-14https://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/216Ajouter un bouton > Style par défaut2023-03-10T11:55:22+01:00Maxime ChazalvielAjouter un bouton > Style par défautLorsqu'on fait des modif de style dans la visu
ensuite on change de biosource
on recree une visu
elle est avec ces styles
peut-etre pratique pour l'utilisateur mais si on a fait des styles bizarre, pas tres facile de les supprimer
avoir...Lorsqu'on fait des modif de style dans la visu
ensuite on change de biosource
on recree une visu
elle est avec ces styles
peut-etre pratique pour l'utilisateur mais si on a fait des styles bizarre, pas tres facile de les supprimer
avoir un bouton a cote du bouton appliquer style, un autre bouton recharger les styles par defaut?Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardohttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/69Ajouter un retour des options d'affichages aux options par défaut2020-02-04T08:32:52+01:00Seyer AlexandreAjouter un retour des options d'affichages aux options par défauthttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/87Aperçu de l’abstraction2020-03-16T17:56:41+01:00Maxime ChazalvielAperçu de l’abstractionRelease Aperçu de l’abstractionAmina TaouiAmina Taouihttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/198Arrondie sur les valeurs de flux2023-03-10T11:54:13+01:00Maxime ChazalvielArrondie sur les valeurs de fluxProposer un arrondi pour les labels sans arrondi sur les valeurs.
En faisant des arrondis, j'épure bien l'affichage mais je risque de
réduire à 0 un flux qui ne l'est pas…
Y'a moyen de ne pas importer de valeurs arrondis mais de choisir...Proposer un arrondi pour les labels sans arrondi sur les valeurs.
En faisant des arrondis, j'épure bien l'affichage mais je risque de
réduire à 0 un flux qui ne l'est pas…
Y'a moyen de ne pas importer de valeurs arrondis mais de choisir le
nombre de chiffre après la virgule pour l'affichage des valeurs?Maxime ChazalvielMaxime Chazalvielhttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/19ATP juste en substrat ou juste en produit2019-03-21T16:46:51+01:00Maxime ChazalvielATP juste en substrat ou juste en produithttps://forgemia.inra.fr/metexplore/MetExploreViz/-/issues/155Avoid label overlapping (like ggrepel)2022-11-07T08:55:04+01:00Louison FresnaisAvoid label overlapping (like ggrepel)Le placement des labels est assez fastidieux et non sauvegardé dans le JSON.
Du coup il serait intéressant d'ajouter une option permettant de les placer automatiquement pour éviter qu'ils s'overlap (un peu comme ggrepel dans R).
A titre ...Le placement des labels est assez fastidieux et non sauvegardé dans le JSON.
Du coup il serait intéressant d'ajouter une option permettant de les placer automatiquement pour éviter qu'ils s'overlap (un peu comme ggrepel dans R).
A titre d'exemple voilà un lien vers cette fonctionnalité présente dans ggplot:
https://www.r-bloggers.com/2016/01/repel-overlapping-text-labels-in-ggplot2/
Merci !Jean-Clement GallardoJean-Clement Gallardo