add R commands

README.md

@@ -82,12 +82,14 @@ Pour lancer les analyses:
 
 - Sur tous les sites:
 1. Ouvrir le fichier "run.sh" et faire les modifications nécessaires (nb d'itérations,...)
-2. Dans un terminal (linux): ./run.sh 
+2. Dans un terminal (linux): 
+> ./run.sh 
 
 - Pour un site:
 1. Ouvrir le script *analyse_stade.R* dans le dossier correspondant (ex: /SITE/adult/)
-2. Modifier le chemin du répertoire (localisation du fichier)
-3. Lancer le script dans R
+2. Modifier le chemin du répertoire dans le srcipt (i.e. localisation du fichier; section "WORKING DIRECTORY")
+3. Lancer le script dans R ou depuis un terminal avec la commande:
+> R CMD BATCH analyse_adult.R
 
 
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