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Commit e9ce3f7d authored by magali's avatar magali
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202111_Rotenone/report_Rotenone.Rmd
View file @ e9ce3f7d
......@@ -151,9 +151,9 @@ qsub -cwd -V -N multiqc -o LOGS -e LOGS -b y "conda activate multiqc-1.8 && mult
```
Numéro du job **fastqc** sur le cluster de migale: 4045739.1-40:1
Numéro du job **fastqc** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4045739.1-40:1
Numéro du job **multiqc** sur le cluster de migale: 4045740
Numéro du job **multiqc** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4045740
Lien vers le [rapport multiqc](MULTIQC/multiqc_report.html)
......@@ -243,7 +243,7 @@ qacct -j 3982109
```
Numéro du job **preprocess** sur le cluster de migale: 4046130
Numéro du job **preprocess** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4046130
Les paramètres suivants ont été choisis :
......@@ -278,7 +278,7 @@ qacct -j 4046530
```
Numéro du job **clustering** sur le cluster de migale: 4046530
Numéro du job **clustering** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4046530
### Remove Chimera
......@@ -291,7 +291,7 @@ qacct -j 4046537
```
Numéro du job **chimera** sur le cluster de migale: 4046537
Numéro du job **chimera** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4046537
Lien vers le [rapport remove_chimera](FROGS/remove_chimera.html)
......@@ -318,7 +318,7 @@ qsub -cwd -V -N filters -o LOGS -e LOGS -pe thread 8 -R y -b y "conda activate f
qacct -j 4046541
```
Numéro du job **filters** sur le cluster de migale: 4046541
Numéro du job **filters** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4046541
Lien vers le [rapport filters](FROGS/filters.html)
......@@ -346,11 +346,11 @@ qsub -cwd -V -N affiliations_stats -o LOGS -e LOGS -b y "conda activate frogs-3.
```
Numéro du job **affiliation** sur le cluster de migale: 4046545
Numéro du job **affiliation** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4046545
Lien vers le [rapport affiliation_OTU](FROGS/affiliation.html)
Numéro du job **affiliation_stats** sur le cluster de migale: 4046552
Numéro du job **affiliation_stats** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4046552
Lien vers le [rapport affiliations_stats](FROGS/affiliations_stats.html)
......@@ -365,7 +365,7 @@ qsub -cwd -V -N biom_to_tsv -o LOGS -e LOGS -b y "conda activate frogs-3.2.2 &&
```
Numéro du job **biom_to_tsv** sur le cluster de migale: 4046554
Numéro du job **biom_to_tsv** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4046554
Je vais "rectifier" toutes les multis affiliations sur **affiliationExplorer** en important **multi_aff.tsv** et **affiliation.biom**
......@@ -381,7 +381,7 @@ qsub -cwd -V -N affiliations_stats_cleaned -o LOGS -e LOGS -b y "conda activate
```
Numéro du job **affiliations_stats_cleaned** sur le cluster de migale: 4049992
Numéro du job **affiliations_stats_cleaned** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4049992
Lien vers le [rapport affiliations_stats_cleaned](FROGS/affiliations_stats_cleaned.html)
......@@ -401,7 +401,7 @@ qsub -cwd -V -N tree -o LOGS -e LOGS -b y "conda activate frogs-3.2.2 && tree.py
```
Numéro du job **tree** sur le cluster de migale: 4049993
Numéro du job **tree** sur le cluster de calcul de la plateforme Migale: 4049993
Lien vers l'arbre [Tree](FROGS/tree.html)
......
202111_Rotenone/report_Rotenone.html
View file @ e9ce3f7d
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