Commit 9dfddb08 authored by Celine Noirot's avatar Celine Noirot
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......@@ -43,7 +43,7 @@ singularity pull template-nf.sif oras://registry.forgemia.inra.fr/get-nextflow-n
- pour le reproductibilité : `Singularityfile` et `environment.yml` (si besoin en plus: `Dockerfile`)
## Et apres ?
- nomenclature: les channels doivent etre nommée comme suis: ch_FILE1_for_PROCESS_DESTINATION
- mettre en place des données de tests
- lorsque l'on code un process :
- utiliser les labels (pour la memoire, cpu, temps) définis dans base.config
......@@ -52,7 +52,9 @@ singularity pull template-nf.sif oras://registry.forgemia.inra.fr/get-nextflow-n
- completer le `doc/output.md` et le `doc/usage.md`
- tagger un pipeline dès que les fonctionnalités attendues sont codées
# Documentation a completer pour les pipelines suivants :
> La documentation suivante est a modifier et a garder. La precedente est a supprimer.
## Introduction
......
1,MT,./data/MT_rep1_1_Ch6.fastq.gz,./data/MT_rep1_2_Ch6.fastq.gz
\ No newline at end of file
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