- mv after bismark_extraction
- processing step
- option of rmdup (-s for single and not for paired)

Bug fixes
Code cleaning
Documentation
Analyzebed : now allow boxplot and barplot in web interface
Python3 updates
Argparse for scripts

modification de la visualisation des boutons refresh et rerun lors de la visualisation du pipeline : 
intervertion des deux boutons.

adding part of informations of https://hebdo.framapad.org/p/ng6doc, in Add workflow, Add Analysis and Format sections.

standarisation : bugfix python3
others: Not important

No commit message

modification du template de splitbc vu que l'on ne fait plus la vérification de radtag dans split bc mais dans processRadtag

pool non required
suppression des options tag_mismatch, rad et radtag (pour splitbc) car problème pour adapter au double digest
ajout d'une enzyme2 à process_radtag

suppression des anciens composants : RADqc_preprocessing.py, clone_filter.py, fastuniq.py, process_radtag.py

modification de l'import des données dans la base de donnée.
bug fix

modification de l'analyse pour prendre en compte l'analyse process_rdtag et clone_filter si dereplicate
gestion du postprocess des analyses qui était avant dans RADqc_preprocessing

association de process_radtag et clone_filter dans une seule analyse pour le moment process_radtag mais a changer
l'analyse RADqc_preprocessing n'existe plus

cnv2bed.py : minor bugfix
merge_sv.py: Added Doc, minor bugfix, modified launching code (still dirty)
Analyzebed.py: new analyse --> still in dev
breakdancer.py: Doc
cnvnator.py : 1 input file --> several input files, bugfix (chromosome)
delly.py Fixed issue when no created files
merge_intra: removed
standardisation: working now

No commit message

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