Ajouter assemblathon après PROKKA (et donc uniquement sur les contigs >200bp)
Assemblathon a déjà été lancé après l'assemblage, mais prenait en compte tous les contigs à l'issue de l'assemblage. Prokka supprime des contigs (tous les contigs < 200bp) et donc les valeurs obtenues avec l'assembathon ne devraient pas être les mêmes qu'après l'assemblage.