Rerun of prokka
Février 2021: Après avoir lancé metagWGS jusqu'au 08_binning et obtenu les résultats sans erreur (3 samples de test avec 5 millions de reads), j'ai voulu le lancer jusqu'à l'annotation fonctionnelle (étape 06_func_annot). Les jobs prokka avaient déjà été lancés lors de l'analyse avec l'étape 8_binning mais ils se sont relancés lorsque j'ai lancé le script avec l'étape 06_func_annot. Lors de cette relance, les jobs prokka n'étaient toujours pas terminés au bout de 1 jour et 23h pour les 3 échantillons alors que lors du premier lancement du pipeline (pour 08_binning) ils avaient tournés en une trentaine de minutes. J'ai donc killé le job du script et les jobs prokka et relancé le script permettant d'avoir l'analyse de l'étape 06_func_annot. Ce nouveau lancement a relancé les jobs prokka et est en cours. J'ai lancé metagWGS sur 3 jeux de données différents quasiment au même moment et le problème est arrivé sur 1 des 3 jeux de données.