Skip to content

GitLab

  • Menu
Projects Groups Snippets
  • Help
    • Help
    • Support
    • Community forum
    • Submit feedback
    • Contribute to GitLab
  • Sign in
  • metagWGS metagWGS
  • Project information
    • Project information
    • Activity
    • Labels
    • Members
  • Repository
    • Repository
    • Files
    • Commits
    • Branches
    • Tags
    • Contributors
    • Graph
    • Compare
  • Issues 36
    • Issues 36
    • List
    • Boards
    • Service Desk
    • Milestones
  • Merge requests 0
    • Merge requests 0
  • CI/CD
    • CI/CD
    • Pipelines
    • Jobs
    • Schedules
  • Deployments
    • Deployments
    • Environments
    • Releases
  • Monitor
    • Monitor
    • Incidents
  • Packages & Registries
    • Packages & Registries
    • Container Registry
  • Analytics
    • Analytics
    • Value stream
    • CI/CD
    • Repository
  • Wiki
    • Wiki
  • Snippets
    • Snippets
  • Activity
  • Graph
  • Create a new issue
  • Jobs
  • Commits
  • Issue Boards
Collapse sidebar
  • genotoul-bioinfo
  • metagWGSmetagWGS
  • Issues
  • #108

Closed
Open
Created Jan 15, 2021 by Joanna Fourquet@joanna.fourquetMaintainer

eggnog-mapper: use PFAM database?

See https://github.com/eggnogdb/eggnog-mapper/issues/261#issuecomment-760457698 A discuter, mais actuellement les bases de données PFAM et MMseq2 sont téléchargées dans le process eggnog_mapper_db. Les supprimer si on se rend compte que ce n'est pas nécessaire de les télécharger et à garder si finalement on souhaite les utiliser dans le process eggnog_mapper.

Update: on ne s'en sert pas, donc simplement ne pas DL PFAM et MMseq2

Edited Sep 29, 2021 by MARTIN Pierre
Assignee
Assign to
Time tracking