GitLab

DataDiscovery aims at providing researchers a simple and fast access to relevant biological data using specific keywords and easy to use filters.

This tool is expected to be easily customizable for specific filters, environments, or data schemas.

Connecteur entre dataverse et jupyterhub

Le projet Gestion Automatique d'Environnement Virtuel.

ICEscreen detects and annotates ICEs (Integrative and Conjugative Elements) and IMEs (Integrative and Mobilizable Elements) in Firmicutes genomes.

metagWGS is a workflow dedicated to the analysis of metagenomic data. It allows assembly, taxonomic annotation, and functional annotation of predicted genes. It has been developed in collaboration with several CATI BIOS4biol agents.

mixKernel is a multiple kernel framework that allows to integrate multiple datasets of various types into a single analysis.

Next Generation Sequencing Information System

Projet de la version V2 de l'application des ORE.

Le projet est constitué de 2 sous projet :

La partie serveur qui fournit les web services de l'application

La partie UI qui fournit une interface VueJS permettant d'interroger ces Web Service

Scripts related with database development in stacomi.

Fish migration monitoring, database connection and treatment

Exploitation et maintenance du thésaurus INRAE, thésaurus ouvert et partagé couvrant les domaines de recherche d’INRAE. Il sert de référentiel au sein de l’institut pour indexer et annoter des documents, pages web, descriptions d’activités, jeux de d