Atelier_excel
Fichier (matrice excel) à télécharger : Matrice_atelier_excel.xlsx
1- Préparation de la matrice de données : IMPORTANT Bien préparer sa matrice de données :
- Ligne de titres
- Eviter les trous dans la matrice ! (remplacer par une valeur neutre)
2- Exploration du fichier
- Se déplacer dans le tableau : aller en bas sans la souris, sélectionner tout le tableau…
- Trier par 2 critères : 1- ID CHROM, 2-Pos1
- Filtrer les COPIA1 situés à moins de 100.000 du début d’un chromosome
- Eliminer les doublons
- Etablir la liste des transposons
3- Manipulations, calculs dont recherchev, mise en forme conditionnelle, filtre élaboré
- Calculer dans la colonne E, la taille de chaque alignement (pos2-pos1+1)
- Ramener dans la colonne F, la taille de chaque chromosome
- Calculer le % de couverture de chaque alignement sur le chromosome (E/F)
- Ajouter une barre de couleur proportionnelle aux valeurs sur les % de couverture
- Colorer en bleu toutes les tailles d’alignement comprises entre 200 et 500
- Filtrer la matrice en ne gardant que les consensus de la sous-liste
- Copier les ID CHROM en colonnes et les len chrom en lignes
4- Tableau croisé dynamique
- Afficher la taille de chaque chromosome
- Afficher la somme des tailles d’alignements par chromosome
- Afficher la somme des % de couverture par chromosome
- Recalculer la somme des % de couverture par chromosome à partir des sommes des tailles d’alignements et de la taille des chromosomes : ATTENTION !!! Refaire en copiant-collant valeur le tableau
- Afficher pour chaque chromosome, les transposons associés, et les moyennes des tailles d'alignement (tout en ligne, puis les chromosomes en lignes et les transposons en colonnes)
- Afficher les résultats uniquement pour le chromosome 6 (filtre)
Corrigé : Atelier_Excel_corrigé.docx
* 3 décembre, animé par Adeline Simon & Isabelle Fudal Sessions :
Participants : Antoine, Noémie, Muriel, Mathilde, Laetitia, Stéphanie, Audren, Tin-Suong, Nacera